【分集劇情】 
第1集
   外科醫生陳赫在為送到醫院的一名身份不明的病患動手術,清除其腦腫瘤時意外地發現其腦內有胎兒的組織成分,並且聽到一個怪異的呼喚「回去」,引起腦部劇烈疼痛。堅持完成手術後,他把取出來的胎兒組織成分放在辦公室的試劑瓶中,在接到美娜的電話回家後,女友劉美娜提前為他過生日,兩人玩的很開心。
   第二天準備向美娜求婚的陳赫打電話約美娜,但她卻去參加醫療志願活動。志願活動中美娜碰到兩父子一起生活的孩子,其父親在工地上腦部受傷,送到醫院後,陳赫檢查說沒有希望,但美娜依然堅持要讓其做手術,兩人起了爭執,美娜傷心地開車離去。在十字路口遭到車禍,陳赫驚呆。陳赫為美娜做手術,在手術快成功時卻大出血,又一次令陳赫頭疼聲音再次出現。手術雖然成功,美娜卻未清醒。
   之前不知名的腦瘤病患偷出醫療器材和試劑瓶跑出,手術結束後在天台休息的陳赫,碰到病患拿著東西,還邊說要回去,兩人爭搶試劑瓶,不料陳赫跌下樓,穿越到1860年的朝鮮時代。
   好不容易相信是穿越到朝鮮時代的陳赫,被捕盜廳當成劫匪,到處懸賞通緝。被李顯應搭救後,在市集上偶遇與現代的劉美娜一模一樣的女性。
   在躲避官府追緝時,遇到了因中槍需要急救的洪英來的哥哥。


第2集
   陳赫將英來的哥哥洪英徽背回家,面對與美娜相貌相同的英來,仍感震驚。
   英來懇求陳赫救自己的哥哥一命,在思想鬥爭後,陳赫決定實施朝鮮時代第一例開顱手術。手術過程波折不斷,陳赫與英來發生了激烈的衝突,好在最後順利進行。由於之前英來派人去官府舉報,陳赫在手術之後,被官兵抓走。
   洪英徽科舉後並未出仕,佯裝有病在家,實則是反對團體的領導人。景卓以為英徽是被盜賊所傷,來其家探望。
   深感歉意的英來和李顯應,為了解救陳赫多方奔走,但仍舊無果。
   武官金景卓也發現出盜竊案的諸多疑點,但迫於左相金秉希的壓力,維持對陳赫死刑的原判。就在刑場之上,英來與手術後醒來的哥哥英徽及時趕到,與朝堂大人對質,再次為陳赫翻案。


第3集
   陳赫即將被斬首時,左相突然暈倒,救父心切的金景卓允許陳赫實施手術。經過兩次開顱後,終於找到了血腫塊,救人有功的陳赫也免於一死。
   為了慶祝左相大人康復,受邀的陳赫與英來前去道賀。陳赫受到了禮遇,但英來卻被眾人奚落一番。景卓對傷心離去的英來表明了自己的心意。花魁春紅與苦戀自己的左相長子一同跳入河中,未將對方溺死,反而自己溺水。陳赫將她救起後,春紅對醫生的好感更加提升。
   回家途中的陳赫與英來遇到被快馬踏傷的植兒母親。英來不顧性命將醫用包取回,但手術前又遭到了植兒父親的反對,爭執中陳赫的手受傷,仍帶傷堅持完成側頭動脈縫合手術。英來對醫用包發揮的功效感到神奇,陳赫在談到治病救人時,不禁回想起美娜的種種,並追問英來和未婚夫景卓的訂婚原由。
   回家途中,遇到一個嚴重腹瀉的村民,欲將其救起的陳赫,看到英來驚恐的神情,才知道是霍亂。


第4集
   左相召集群黨商議對付霍亂之危,將都城與城外隔離,並任命陳赫去活人署醫治。
   陳赫從英徽那得知,他的父親洪參判病死於霍亂,全家人陷於絕望期間,英來卻堅持照顧到其臨終,所以她對霍亂特別恐懼和害怕。英徽希望陳赫重新慎重考慮,陳赫仍決定冒著風險出城治病。
   來到活人署的陳赫對眼前的景象驚呆,醫員丟下病人忙著逃跑,大量的霍亂患者苦不堪言,無人救治。陳赫與忙著為村民貼護身符的許醫員發生爭執,但無奈說服不了他們的傳統觀念。許醫員也得了霍亂,被同僚丟棄,陳赫帶著他去給植兒母親看病。
   英來出去打聽城外的情況,遇到暴民,就在危機之時被景卓救下。關心英來的景卓展現了體貼的一面。
   僅以調製的鹽水、糖水勉強緩解患者症狀的陳赫,面對疫情感到絕望。植兒的父親和趕來的李顯應主動提出幫忙。李顯應順籐摸瓜,從周八那裡找到了趁著霍亂之危,囤貨居奇的幕後主使,竟是左相長子。在春紅的幫助下,智取到500兩。得知情況的英來也趕去支援陳赫,並與他互相鼓勵。
   打算帶英來離開疫區的景卓,遭到了拒絕,不惜拔劍與陳赫相對!


第5集
   植兒的父親打造出簡易版點滴用器具,陳赫給英來示範如何靜脈注射。面對執意要帶走英來的景卓,陳赫坦誠是自己要求她前來幫忙。李顯應怒斥景卓一番。命福因霍亂加重病危,陳赫知道他就是日後繼位的高宗,命不該絕,採用了大腿的靜脈注射後,身體康復。
   英徽和其成員偷偷送來大量援助物資,眾人欣喜,看到戰勝霍亂的曙光。因為連續過度勞累,陳赫感染上霍亂!左相得知英來在疫區幫忙,感到不滿。英來按照陳赫的醫囑,為他靜脈注射。倍感失落的景卓借酒消愁,找英徽談論起兒時相處的種種,作為庶出,從小就只能低頭做人,深感壓抑。
   得知陳赫病情的春紅前來探望,打算給他換一個更好的環境去治療,遭到了英來的拒絕和阻止。陳赫病危,英來對他大腿靜脈注射。昏迷中的陳赫聽到呼喚醒來,度過霍亂之危。
   劉御醫向左相提議,燒燬土幕村,以絕後患。景卓激烈反駁未果,為保護英來,只得請命前往。英來對此行徑感到痛恨,與景卓的隔閡進一步加深。植兒的母親在大火中為保護植兒離開人世,眾人傷痛之餘,陳赫發覺自己並不能改變歷史原有的軌跡。


第6集
   霍亂結束後,陳赫繼續留在活人署工作,給醫員講解醫學知識。來此探望的英來向陳赫打聽美娜的事情。
   以無名客身份劫盜的英徽,將大量贓物與周八銷贓交易,被偷偷跟蹤而來的李顯應發現。英徽雖放走了李顯應,但以其性命威脅他禁言。
   春紅邀請活人署一行人前來並熱情招待,她請求陳赫為自家的一名妓生桂香看病。陳赫診斷桂香患梅毒,並向春紅和李顯應解釋了病發的原因。因為當時沒有青黴素,所以陳赫判定此病無救。李顯應回想起當年他因幫助桂香擺脫金大鈞非禮,而與她熟識。
   陳赫在活人署與許醫員談論當時的治療手段,決定在去妓坊查看病情,英來執意要同去,陳赫只得答應。妓生因為害怕外界流言,紛紛拒絕檢查。英來按照陳赫先前的指點,為春紅做了身體檢查。劉御醫勸桂香喝下水銀解脫,被陳赫阻止。
   景卓向陳赫鄭重交涉,禁止他再帶英來外出行醫。陳赫回想起手工提取盤尼西林的事情,嘗試繪製草圖。
   桂香被李顯應的肺腑之言所感,說出了自己患梅毒的原因。怒不可遏的李顯應查出了害桂香得梅毒的洋人,與金大鈞有關。陳赫意識到如果此時發明了盤尼西林,將改變歷史正常的行進,決意放棄研製。
   為絕後患,與金大鈞串通的劉御醫欲將桂香帶走,豈料李顯應已先前一步把桂香轉移,並要求陳赫照顧。


第7集
   李顯應通過周八的幫助終於知道桂香得病全拜金大鈞所賜。李顯應帶桂香外逃,陳赫向李顯應表示不能製造盤尼西林來救桂香,那樣會徹底改變歷史。
   景卓終知道兄長劣行。陳赫在街邊尋找到打算離開的桂香,意外看到她所處的窘境,因不忍心而最終答應救治桂香。陳赫回到活人署,與一眾人等研製出盤尼西林。
   李顯應深夜來找英徽,向他說明金大鈞私自買賣金塊的事情,英徽懷疑李顯應的目的,李顯應表示只是想懲罰傷害桂香的人。
   得知真相的景卓稟告了父親,左相震怒,讓金大鈞盡快運走私金,同時安排景卓找出桂香。英徽來金府偷盜私藏的金塊,離開之時遇到景卓,雙方交手,英徽脅迫左相後成功逃走。陳赫、英來帶著研製成功的盤尼西林前來救治桂香。因為沒有抓到英徽一行人,金大鈞埋怨景卓,景卓表示定會迅速解決一切。
   景卓派人搜查未找到桂香。陳赫得知李顯應偷了金大鈞的金塊與其大吵,正在此時,劉御醫借口來活人署搜查桂香。因李顯應和周八提前準備,劉御醫未成功找到人。李顯應用金塊買通周八,打算幫桂香逃走。景卓卻跟蹤春紅,提前抓到了桂香。金大鈞對桂香逼供,英來向景卓求情,承諾如果救活桂香將絕不再進出活人署,幫陳赫爭取到救治病人的機會,可惜被左相阻止。陳赫再三爭取之際,桂香已咬舌自盡。
   左相表揚景卓的辦事作風並要賞賜他,景卓表示想盡快完婚。景卓到洪家正式提親,英來不安。活人署中,慕名前來的病患讓陳赫忙的不可開交,李顯應找陳赫出診醫治一位貴婦人,陳赫準備為貴婦人切除掉腫瘤。


第8集
   英來的母親希望陳赫搬家,以方便女兒和景卓完婚。英來想延後婚期,英來母親堅決反對。翌日,陳赫搬離洪家,英來不捨,陳赫彆扭的向她送上祝福。陳赫暫時搬到活人署居住。景卓興致勃勃的和英來約會,並回憶起小時候的往事,英來有些愕然。
   李顯應拉攏英徽等人,密謀推翻現有王朝,英徽不置可否。陳赫要救治的貴婦人竟是大妃娘娘的侄女,即將動手術之際,家人強烈反對並將陳赫問罪,貴婦人哭訴請求終化險為夷。
   劉御醫買通活人署某醫員,為陷害給大妃娘娘侄女治病的陳赫,打算燒掉所有盤尼西林。
   景卓與英徽相約喝酒,席間英徽若有所指的希望景卓可以保護好自己的妹妹;英徽、景卓、李顯應、陳赫因偶遇一起飲酒。酒席間,景卓不斷挑釁陳赫,陳赫針鋒相對後提前離開。
   深夜,英來帶著陳赫留下的衣物,獨自外出想要尋找他,而此時的陳赫為急救大妃娘娘的侄女正在回到活人署的路上。英來來到活人署,看到有人偷偷放火,遂衝進火場搶出一支盤尼西林,卻不慎被重物砸倒燒傷。陳赫診治英來之時,景卓前來,英來向他說明有人故意縱火。陳赫權衡病勢,向英來表明要為大妃娘娘侄女使用唯一的盤尼西林,英來忍痛贊同。
   英來母親私自帶走女兒,陳赫追到家中治療,景卓查看活人署火勢後開始懷疑許醫員。景卓威脅陳赫一定要救活英來。許醫員為搶回被自己賣出的盤尼西林而遭到毒打,被周八偶遇後救回,英來也最終因藥得救。
   劉御醫為金大鈞出招要除掉李顯應、陳赫。英徽救下李顯應,英來救下陳赫。得知刺殺真相的李顯應向大妃娘娘覲見。


第9集
   陳赫面對英來的苦苦挽留,被迫說出自己來自未來世界的真相。
   大妃娘娘想召見陳赫為自己看病。左相眾人知道李顯應覲見大妃娘娘,緊張的商量著對策。英來鼓起勇氣向景卓提出取消婚禮,景卓萬分傷心。景卓至春紅處飲酒,並捏碎酒杯自虐。英來母親因女兒私自退婚大發脾氣,英來被趕出家門。
   李顯應欲說服陳赫覲見大妃娘娘,陳赫不肯捲入鬥爭,李顯應說明前一晚兩人被刺殺的真相。
   英來暫時搬入活人署。景卓向父親說謊,成功退婚。陳赫偶遇景卓,向他說明英來行蹤,景卓故作漠不關心。英來在活人署與眾醫員學習醫術。有人因盤尼西林治死病人大鬧活人署,景卓遂抓捕陳赫等人,這一切原是金大鈞等人的陰謀,最後陳赫等人被杖責,活人署關閉,盤尼西林全部沒收。英徽與李顯應飲酒,春紅爆出自己是無名客內線的身份。
   為重開活人署,陳赫被迫答應李顯應,使計繞過左相耳目覲見了大妃娘娘。因劉御醫阻撓,重開活人署計劃並未得到大妃娘娘許可。在陳赫即將離開皇宮之時,偶遇戲班有人胃潰瘍穿孔,陳赫悉心診治,其醫術終得到大妃娘娘認同,活人署得以重開。李顯應借此機會,提議要為大妃娘娘辦一個盛大的生日宴會。
   李顯應牽線讓周八在妓坊開設了賭場,賺的盆滿缽滿。李顯應查賬之際,英徽前來質問他搞大生日宴會的真實目的。


第10集
   英來母親突然暈倒,卻拒絕陳赫的治療。左相得知李顯應開設賭場的事情,始覺不妙,遂召集官員共同拒絕大擺生日宴席,大妃娘娘進退兩難。
   李顯應讓兒子命福好好閱讀資治通鑒。英來得知母親的病因自己而起,十分內疚。李顯應擾亂左相酒局,提出自己被刺事件金大鈞是幕後兇手,最終逼迫左相贊成大擺大妃娘娘生日宴會的提議。
   陳赫等人為英來母親製作出玄米甜甜圈。左相讓景卓嚴懲抓到的無名客,金大鈞因嫉妒景卓而找他麻煩。周八為準備大妃娘娘壽辰而被封官職。英徽為營救無名客來到妓坊找李顯應,向李說明他如不努力營救則無法合作,可惜此時無名客已被砍頭示眾。周八、李顯應緊張的準備著壽辰,李巧遇活人署的眾醫員並品嚐到玄米甜甜圈。
   眾多無名客慫恿英徽在大妃娘娘壽宴上刺殺左相,英徽來找景卓閒聊,話中若有所指。英來為大妃壽宴準備了特製甜甜圈並交給李顯應。英徽等人緊張的準備著刺殺行動,因為命福的關係,景卓發現了藏在房頂待命的英徽。景卓不知無名客是英徽,用火槍打傷了他,刺殺行動失敗。
   李顯應帶著命福拜見大妃娘娘,並吃了甜甜圈。景卓攔住無名客英徽,兩人交戰,英徽因手下留情被景卓認出,同時景卓無奈放走英徽。
   大妃娘娘品嚐了一口活人署進貢的甜甜圈即中毒暈倒,在陳赫的指導下,劉御醫為大妃娘娘成功洗胃。陳赫、英來被冠以向大妃投毒之名而抓捕。李顯應與春紅商議如何營救陳赫、英來。金大鈞對陳赫、英來逼供,誘使他們供出投毒乃李顯應指使所為。面對燒紅的烙鐵,英來嚇得暈了過去。


第11集
   景卓面對英來、陳赫的逼供現場表示出「漠不關心」,英來母親因此事暈倒。
   景卓對左相隱瞞了英徽是無名客的事實,同時欲請求左相饒恕陳赫和英來,左相不允。劉御醫帶著提前被收買的活人署醫員指證投毒是李顯應指使陳赫、英來做的,李顯應因此被捕。周八調查投毒事件後發現大妃娘娘的一名侍女可疑,英徽、周八遂開始尋人。
   左相私自下旨,翌日處決陳赫、英來、李顯應。深夜,英徽對景卓拔刀相向,求他抓自己而放過妹妹英來,景卓未抓英徽同時暗派人手重新調查投毒一事。逃走的宮女向景卓坦白,投毒是左相指使的,並獻上了當日沾毒的食盤,為隱瞞真相,景卓取走證物、殺掉宮女。因為食盤的舉證,陳赫、英來被釋放,因左相從中作梗,李顯應被流放。陳赫、英來得知是被景卓所救,左相逼迫景卓自盡以示清白,景卓雖最終未死,但被降職到地方。
   陳赫與春紅談起李顯應,突然發現春紅貌似知道某些未來的事情。左相等人欲催促主上下達賜死李顯應的旨意。陳赫向春紅討教回到未來的方法,春紅表示陳赫認識了英來並救治了左相,他已經修改了歷史,只有恢復歷史才能回到未來。想著春紅的話,回到活人署的陳赫趕英來回家。
   英來回到家中得知哥哥離家出走,決定親自去尋找。陳赫得知李顯應將被賜死,與周八一起迅速趕來。途中,陳赫、周八被強盜所劫,卻意外救治了強盜頭目,最終被順利釋放。陳赫欲救走李顯應,李顯應卻欣然接受聖命。


第12集
   因百姓暴動,李顯應未成功飲下毒藥。左相派被貶謫的景卓去平叛。恢復健康的大妃娘娘取消了賜死李顯應的旨意。李顯應暫時平息了民怨,也接到判定無罪的諭旨。前來尋找哥哥的英來因救一女子惹惱惡縣監,被陳赫等人救出。李顯應、周八繼續回漢陽,陳赫陪英來去尋找英徽。
   李顯應拜見大妃娘娘,並向大妃獻計以平息地方的百姓暴動。陳赫與英來為是否救治受傷的縣監發生爭吵,陳赫獨自診治,英來在外阻擋追到此處的暴動百姓。最後,百姓將縣監連同陳赫、英來一起抓走。左相作梗,李顯應平息民憤的奏折未被呈上。
   被抓回來的陳赫與英來發現暴動百姓的頭目竟是英徽;景卓決定次日帶兵救出被抓的縣監。英徽堅持領導民眾,並拜託陳赫照顧英來。陳赫終於發現他改變歷史的源頭在於救治了英徽。景卓帶兵平叛,英徽帶人抵抗,山城最終被官兵攻下。陳赫為救人與英來折返。景卓與英徽交戰至懸崖處,景卓不忍殺害棄械的英徽準備離開,被抓的縣監此時卻趕來槍殺了英徽,震怒的景卓殺了縣監,看著英徽在面前死去的陳赫、英來幾近崩潰。
   為幫助陳赫進入內醫院,春紅、李顯應、周八使計掌握了左相的一名跟隨者。左相對景卓的平叛結果相當滿意,決定召回他。
   陳赫自責地照顧著生病的英來,景卓留下了英來,讓陳赫獨自離開。李顯應說服大妃娘娘幫陳赫進入內醫院;得知真相的左相也順勢同意了此事。回到活人署的陳赫告知李顯應英徽已死的事實;為恢復歷史,他決定進入內醫院,卻不知左相同意此事是為日後找他做替罪羊。


第13集
   李顯應、陳赫、劉御醫拜見主上,李顯應向主上隆重推薦陳赫,但主上對陳赫的醫術不以為然,拒絕接受診治。許醫員向進入內醫院的陳赫表示祝賀。
   景卓陪英來回到家中,大家約定向英來母親隱瞞英徽已死的真相。雨中,陳赫在英來家外面等待,英來不理睬陳赫,獨自在屋中哭泣。成功歸來的景卓拜見了父親,左相將他派往禁衛營。李顯應帶著命福拜見大妃娘娘,大妃考命福,命福對答如流,大妃娘娘很是歡喜。
   第一天來到內醫院的許醫員和陳赫為主上送藥,卻不慎惹惱主上引致其病發;陳赫用紙袋實現了成功急救。李顯應對大妃曉之以情,拜託大妃收命福為養子分.享者電.視。李顯應在宮中遇到正在守衛的景卓,兩人在交談中針鋒相對。陳赫在街市上遇到英來遂向她道歉,英來表示無法面對他所以不會再去活人署。
   景卓將大妃要收養子的信息告訴了左相,左相搬出主上一同前去想要阻止此事;李顯應恰巧前來,大妃娘娘面對眾人當即表示不會收命福為養子。陳赫來找春紅,詢問自己來到古代的真實原因,春紅拿出魔方,陳赫在提示下發現魔方是自己救治過的一個孩子的玩具,而那個孩子就是十歲時曾經穿越到現代的春紅。
   在左相的盤問下景卓不得已說出英徽是暴動民眾的統領,為免英來貶為官奴,景卓決定迎娶英來。周八喬裝打扮後用英徽偷出的金錠引誘金大鈞上鉤。春紅與英來在活人署門口巧遇,春紅告訴英來她必須與景卓結婚,陳赫才能回到未來。
   李顯應拜見主上,準備呈上金大鈞私自買賣金錠的交易證明;而左相早已得知真相,從而提前做出大義滅親的策略,在形勢上反佔了上風。金大鈞因私自買賣金錠遭流放。英來至金府拜見左相,以應承婚事來解救家人,還被迫承諾將斷絕與活人署的關係。主上急病,李顯應為盡早讓命福稱王,欲阻止陳赫為主上動手術。


第14集
   陳赫與李顯應激烈爭吵,陳赫執意救人。劉御醫因嫉妒陳赫,不准他為主上動手術。英來感覺身體異樣,懷疑自己罹患乳腺癌。陳赫請求左相幫助他說服御醫,讓他可以為主上診治。陳赫向大妃娘娘、李顯應、左相、御醫等人說明因主上嚴重貧血,動手術時需要輸血。李顯應提議由宗親獻血以保證王室的正規血統。
   英來母親積極的準備著女兒的婚禮。由李顯應輸血,陳赫開始了對主上的手術,最終手術大獲成功。大難不死的英徽與春紅碰面。許醫員忍不住向陳赫道出英來患上乳腺癌的事情,陳赫趕來見英來,英來卻避而不見。
   恢復健康的主上不顧左相等人反對,同意大妃娘娘收命福為養子。陳赫向景卓說明英來的病情,景卓決定勸說英來接受陳赫的檢查。李顯應決定重新整理宗親宗譜。
   英來來到活人署接受體檢,景卓在外焦急的等候。陳赫希望英來接受手術,英來斷然拒絕,並要求他向景卓隱瞞自己的病情。不明真相的景卓十分高興。李顯應興奮地前來告訴陳赫,命福將被收為養子,此時陳赫卻在妓坊獨自喝著悶酒。
   睡夢中的英來再一次夢到美娜經歷過的事情,不禁驚慌的大哭起來。春紅開導由宿醉醒來的陳赫,卻不慎將之前與英來見面的事情說漏了嘴,陳赫得知英來執意結婚是為了自己可以回到未來,遂不顧一切的前往景卓處告知真相。景卓、陳赫趕往英來家,英來已離家出走。英來、春紅在街邊相遇,英來逼問春紅告知她,自己究竟是誰。


第15集
   英來質問春紅自己到底是誰,春紅表示絕不能讓陳赫知道此事。陳赫、景卓急切的找著失蹤的英來,陳赫決定要為英來做手術。春紅勸說英來要隱藏真相,那樣陳赫才可以回到未來,英來黯然離開。英來請求神父收留她。
   左相因婚事未成,遷怒英來及其母親,要將他們貶為官奴;景卓被迫說出英來有病之事,暫時穩住形勢。李顯應開始主持編撰王室宗譜。英徽找到李顯應,表示決定投靠他。李顯應集結宗親,提出罷免左相。陳赫找到春紅欲打聽英來的下落,春紅苦勸無果。為掩護隱藏著的神父與英來,一名小孩受傷,英來為其縫合傷口。陳赫終找到英來,決意要為其動手術;春紅得知此事,十分著急。
   左相決定派景卓去制止宗親集結,英徽使計,讓周八假扮安東金氏的人為左相說話,反激起宗親罷相士氣。大妃、主上欲罷免左相之職,歸來的左相對景卓大發雷霆。春紅找到景卓,向其透露了英來行蹤,景卓緊急趕來。陳赫、許醫員為英來做手術,即將縫合之時,陳赫卻突遇當日那種頭痛,導致英來大出血,幸許醫員救治才轉危為安。
   左相借英徽逆賊之名,抓捕了他的母親,陳赫得知後請求李顯應幫忙。景卓表示一定要與英來結婚,並準備強行帶走她,陳赫阻止,景卓離開。英徽求李顯應救自己的母親,李顯應前來找左相,以銷毀左相貪污證據及召回金大鈞為條件,終與左相達成交易。
   陳赫送英來回家,英來母親已知兒子死訊,與英來抱頭痛哭。左相得勢,景卓被罷職及逐出家門;景卓硬闖進屋詢問緣由,左相遂逼迫景卓去射殺李顯應。陳赫感謝李顯應救出英來母親之際,李顯應中槍倒下。


第16集
   李顯應中槍,英徽、周八前去追蹤兇手。英徽與景卓交戰,彼此認出對方,景卓大為驚訝。陳赫將李顯應帶至春紅處救治,春紅為其輸血;周八將景卓打暈帶走。被貶的金大鈞回到家中。陳赫偶然發現英來信奉天主教。春紅依舊勸說陳赫不要違背歷史。周八痛打抓回的景卓,逼問他幕後主謀,卻反遭景卓恥笑。
   陳赫被召入宮,卻被御醫阻撓而未成功診治主上。歸來的路上,陳赫撕毀了剿滅天主教徒的榜文,此時突然遇到頭痛狀況。李顯應突然心跳停止,陳赫趕來為其急救,頭痛狀況又在出現。李顯應醒來,陳赫向他道出自己來自於未來的事實。
   英徽來見景卓,告訴他李顯應得到救治的事情;英徽拉攏景卓一同去打破舊格局,景卓恥笑英徽紙上談兵。英來意外得知是景卓開槍打傷了李顯應。李顯應向陳赫打聽歷史的發展趨勢,陳赫說出李顯應未來將處死眾多天主教徒,李顯應與陳赫約定,絕不會處死天主教徒。
   英來逼問周八終得知景卓被關之地,遂即刻前來。主上病危,陳赫束手無策,李顯應進宮拜見。英來再次前來欲救景卓,景卓卻已逃走。哲宗離世,在後嗣確立問題上,左相與李顯應針鋒相對。景卓來到舊居,回憶著小時候的自己,決心自盡,英來趕來阻止。
   李顯應約見左相,欲用權勢為條件讓左相幫助命福獲得王位,左相本不為所動;李顯應拿出他欲加害宗親的證據,終逼左相就範。陳赫因反覆頭痛終昏倒。深夜雨中,景卓跪拜在左相府門口。陳赫醒來,春紅向他道出,他沒改變一次歷史,腦中的腫瘤將長大一次,陳赫震驚;春紅請求陳赫勿再攪亂歷史,否則他將永久泯滅。
   大妃娘娘面前,左相與李顯應針對王位後嗣問題得出統一結論,共同推選命福為王。左相饒過景卓,還首次破例讓景卓稱呼自己為父親。陳赫頭痛加劇,自感不久將回到未來。


第17集
   陳赫頭疼欲裂,春紅的話在他耳邊不斷迴響。春紅、周八與李顯應共同慶賀命福即將稱王的事情;周八被李顯應封為四品官。暈倒的陳赫終於醒來,英來對陳赫的「病」焦急萬分。
   英徽向李顯應獻計,決定拉攏景卓。金大鈞攛掇父親盜取玉璽,景卓卻表示此法不妥;為表示自己的忠心,景卓被迫接下盜取玉璽的命令。景卓意外得知左相對自己僅僅作為護主的狗看待,不禁傷心落淚。英徽找到喝悶酒的景卓,並勸說他加盟於自己的隊伍,景卓不屑。通過春紅的指引,陳赫知道自己第二天即將回到未來,然而面對英來,陳赫生出太多不捨。
   深夜,景卓帶領親信支走大妃娘娘侍從,並來到大妃殿成功盜取玉璽。翌日,命福稱王,眾人拜謁;新王手舉玉璽向眾人展示,左相一黨始覺被騙。受到封官的英徽回到家中,英來和母親喜極而泣。李顯應與陳赫見面,大讚其能力,陳赫表示自己只能輔助至此。李顯應秘密接見已「倒戈」向自己的景卓,為他大畫朝鮮未來的美麗藍圖。
   陳赫教英來用手術刀,英來頻頻失誤,陳赫一反常態的批評了她。景卓找到出來透氣的英來,面對景卓,英來充滿愧疚。李顯應鼓勵命福盡早親政,暗指盡快趕垂簾聽政的大妃娘娘下台,此舉引來大妃不滿。李顯應不滿大妃想要外戚專權,於是和英徽密謀,決定盡快除掉大妃一黨。陳赫向英來提前告別,並勸說英來少去教堂禱告。
   李校理找到陳赫,希望他為自己的夫人接生;陳赫在提前檢查之時卻發現李夫人胎位不正。李顯應按照自己的意願委任了官員,大妃十分氣憤;李顯應則大講治國之方,迫使大妃讓步。陳赫寫下歷史給李顯應,並再次與他約定決不懲治天主教徒。大妃娘娘與左相聯手欲立新後嗣,同時立下誓約。
   金大鈞意外發現景卓投靠了李顯應,急忙向父親告密。原來,景卓是故意倒戈向李顯應的,他成為了左相放在李顯應一黨的間諜;左相告誡景卓要小心,不要讓李顯應察覺。李夫人難產,陳赫被迫決定在無麻醉條件下為其開刀;李顯應假意前來慰問,實則逼迫李校理轉投靠自己。


第18集
   陳赫緊急為李夫人實施剖腹產;室外,李顯應與李校理兩人卻因政見大為爭執。經過眾人急救,李夫人終於順利產下男嬰。李顯應欲讓陳赫說服李校理投靠自己,陳赫不允。許醫員故意為陳赫和英來製造共處空間,兩人閒聊的很愉快。
   英徽向李顯應獻計,決定審訊李校理以逼其就範,李顯應不敢下此決心。李校理與夫人商議之後,決定投靠李顯應。李顯應與李校理逼大妃下台,大妃嚴厲斥責了他們。左相派景卓盯緊李顯應的動向。陳赫救治了被氣暈的大妃,大妃醒來決定下台。下朝的李顯應和左相針鋒相對。李顯應召見陳赫,陳赫對其施政產生不滿。
   李顯應的夫人找英來救治受傷的神父。景卓深夜潛入宮中盜出陳赫寫給李顯應的關於歷史演變的書信。英來請陳赫幫忙救治神父,陳赫欲為其注射盤尼西林,神父拒絕。英來被迫現出天主教徒身份,終成功救治神父;隨後,陳赫拒絕英來參與對神父的下一步治療。李顯應不顧左相等人反對,終推動撤廢書院行動。景卓再次研讀陳赫寫的書信,發現陳赫的「預言」果然不錯。周八帶人平息了書院學生的示威。景卓決定幫助左相與李顯應對抗。
   景卓來到內醫院找陳赫,並詢問他的真實身份,陳赫雖沉著應對但發現景卓已知自己真實身份。李顯應等人在春紅處飲酒,陳赫前來找春紅但隨即頭痛暈倒。英來欲帶神父前往活人署治療,官兵隨後卻抓捕了其他天主教徒。英徽找景卓幫忙放出李顯應的夫人,景卓搪塞不予放人;李顯應被迫下令釋放全部天主教徒。陳赫醒來,向春紅講出自己夢到美娜生命垂危,春紅假意安慰。
   景卓向左相稟報,李顯應釋放了自己天主教徒身份的夫人,左相大悅。左相等人在朝堂就李顯應釋放天主教徒一事發難,英徽等人向李顯應進言欲抓捕所有教徒;得知真相的陳赫為了英來前來阻止,李顯應不允,與陳赫發生激烈爭執。李顯應向王表示了懲治教徒的決心,官兵遂展開大規模的抓捕。陳赫想前往幫助英來,無奈頭痛發作並感覺美娜離世。英來欲帶神父逃離,不幸被捕。


第19集
   李顯應無奈上疏懲治天主教徒,左相出言譏諷。官兵張貼出英來和神父的畫像,欲抓捕兩位;陳赫欲營救英來,兩人發生爭執。景卓拜見父親,左相再次吩咐景卓要盯緊李顯應等人的動靜。陳赫找許醫員幫忙,將英來和神父以「屍體」為名護送出城。李顯應與英徽、景卓商議,決定從李校理手中得到大妃與左相簽訂的誓約書。陳赫想著歷史,決定無論如何要阻止半島戰爭。
   在等待英來的時候,陳赫偶然碰到一個叫陳順英的小朋友,與其玩耍之際卻突然產生觸電的奇怪感覺。通過景卓告密,左相眾人知道李顯應在打誓約書的主意。李顯應藉故探訪李校理,向他打聽誓約書的事情,李校理假言搪塞。神父欲前往清國帶來艦隊拯救被捕的朝鮮天主教徒,英來阻止,陳赫卻表示無可奈何。深夜,周八等人扮作盜賊潛進李校理家假意偷取誓約書;左相猜測李顯應已得到誓約書而十分氣憤,景卓誓死保護父親
   得到英來指點,陳赫再次找到李顯應,以阻止戰爭為名說服他,並同時提出可提前實施戶布制以穩定民心。陳赫引領李顯應來見神父,景卓派人尾隨而至;最終李顯應與神父達成一致意見,並決定馬上釋放所有天主教徒。景卓利用英徽得知李顯應與神父見面的消息。經過盜竊一事,李校理決定將誓約書交給李顯應。景卓親自追捕神父,成功搶到李顯應與神父簽訂的盟書。陳順英因撿陳赫送給他的紙飛機而受傷,陳赫在救治孩子的時候又產生出奇怪的觸電感覺;更在即將為他縫合傷口之時出現身體逐漸消失的狀況。
   左相拿著李顯應的把柄要挾他,李顯應被迫就範;英徽開始懷疑景卓為間諜。英來感到陳赫與陳順英之間有莫名的關聯。陳赫察覺出美娜與英來之間的聯繫,遂找到春紅並質問她為何要欺騙自己。
   許醫員告訴陳赫,英來又被抓捕。李顯應與左相秘密會面,李顯應請求左相務必保住命福的王位。景卓發現自己抓捕到的竟然是英來。陳赫質問李顯應毀約的原因,李顯應卻表示自己即將退出政壇,陳赫驚愕。


第20集
   陳赫鼓勵李顯應與左相繼續鬥爭,李顯應為了命福卻做好隱退的決心。左相決定將李顯應與神父簽訂的盟書交由戶曹保管。李顯應召集的酒宴上,僅有周八、李校理、春紅幾人,李顯應卻不以為然,決定與眾人痛飲。英徽來探望獄中的妹妹,並勸說她棄教。景卓請求父親釋放天主教徒,左相不允,意欲嚴懲。陳赫來到酒宴上痛罵李顯應;春紅想阻止陳赫對英來的施救,陳赫卻並不理睬。景卓按照陳赫的指引得知了歷史的發展,有些錯愕。陳赫苦苦勸說英來棄教。
   翌日,景卓護送李顯應與神父的盟書至戶曹,途中遇到英徽等人的埋伏,景卓假意受傷幫助了英徽。金大鈞親自審問天主教徒,英來最終仍選擇守護教義,即將行刑之際終於接到釋放教徒的聖旨。被釋放的英來向陳赫坦白她沒有棄教,陳赫沒有責怪英來;英來得知陳赫因為自己而改變了歷史。景卓向左相請罪,並呈上書信給父親。
   朝堂上,因為釋放天主教徒一事,李顯應與左相針鋒相對;李顯應還順勢推進了戶布制。左相開始懷疑景卓,金大鈞主動請求負責調查。李顯應向陳赫討教歷史,陳赫不允。景卓給陳赫帶來他寫給李顯應的書信,陳赫驚訝。
   左相假意請陳赫為自己檢查身體,實則探問陳赫未來人的身份;前來拜見父親的景卓看到陳赫有點詫異。陳赫拒絕向左相透露歷史,左相派景卓找出神父。左相用天主教徒的性命作威脅,逼迫神父將軍艦帶至朝鮮。
   周八發現神父出現在左相家,急忙向李顯應稟報;左相派景卓殺掉神父周圍的隨從,以逼迫神父帶來戰爭。李顯應懷疑陳赫向左相道出朝鮮的命運,陳赫悵然離開。春紅告知英來真相,英來向陳赫道歉並挽留他。陳赫收拾好包袱準備永遠離開,春紅阻攔無果卻意外發現有人要劫殺陳赫。春紅救下陳赫,並拼盡最後力氣告訴陳赫美娜已死。


第21集
   陳赫從春紅口中得知未來世界的美娜已死,幾近崩潰。眾人參加了春紅葬禮,李顯應暗自下定決心要為春紅報仇。金大鈞懲罰暗殺失敗的手下,景卓碰巧撞到此幕,再次與金大鈞發生爭執。
   陳赫獨自來到河邊想念著美娜,並不斷反問自己為什麼會來到古代朝鮮。想著美娜已逝,陳赫決定跳崖,英來極力勸阻;陳赫被迫說出美娜出車禍的事情。朝廷上,眾人商議江華島戰事。左相一黨借戰事故意生事,李顯應決定擔負起所有責任。
   左相等人商議絕不能讓李顯應戰勝,景卓十分不滿。左相單獨與景卓見面,向他詢問戰事的結果,景卓表示戰爭中李顯應一定會贏;左相遂決定要迅速奪回政權。回到內醫院的陳赫和英來知道了江華島的戰事,英來決定親自去說服神父,陳赫堅決反對。左相讓景卓寫一封假的書信以瞞騙李顯應,來達到劫持主上的目的,景卓欲不從,與父親發生爭執。景卓偷偷放下「書信」準備離開,卻偶遇前來的英徽;兩人再次談到信任和背叛。
   李顯應看到主上將被毒死的假告密書信,十分驚愕。英來從許醫員處得知美娜可能已經去世,頓時明白陳赫欲跳崖的原因。為確保主上安全,李顯應決定帶命福到私邸住宿幾天;左相派景卓劫持主上,景卓被迫應允。李顯應約見陳赫,向他問起命福的未來,陳赫表示命福一生平安,李顯應遂放下心來。
   英來向御醫提請上前線,並拜託御醫向內醫院眾人保密。深夜,景卓前來告訴李顯應自己的劫持計劃,隨後假裝落入李顯應圈套而逃跑。空手而歸的景卓向父親承認是自己告密,左相不怒反喜,並集結私兵前來劫殺李顯應。周八、英徽帶人將前來的左相、景卓等人團團圍住,雙方展開激烈交戰。原來金大鈞才是出賣父親和兄弟的幕後黑手,他向李顯應要求要得到父親的官位。
   英徽帶著不慎中箭的景卓來找陳赫醫治,景卓因不想欠陳赫人情而拒絕治療,無奈之下陳赫請英來前來幫忙。李顯應帶人衝進左相府邸,逼迫左相辭官。景卓請求與左相一起告老還鄉,但左相最後仍選擇自殺,景卓痛哭。李顯應決定親自帶兵上前線迎戰法艦隊。


第22集
(結局)
   陳赫為了英來,決定與李顯應一同前往戰場。英徽找到獨自喝悶酒的景卓,勸說他與自己一同前往江華島。看到決定隨軍參戰的景卓,李顯應心中暗自佩服著他的大義。
   城內,民眾因斷糧而哄搶著糧食。金大鈞與法軍隊首領秘密聯繫,欲致李顯應兵敗。景卓悄悄潛入軍營欲刺殺李顯應,終被陳赫制服。補給船被炸,李顯應等人被迫決定使用聲東擊西來打敗外國軍隊。陳赫說服景卓,兩人共同前往城內傳遞軍事情報。深夜潛入城內的景卓和陳赫被官兵當作奸細抓住,幸得英來解救。陳赫要帶走英來避難,英來說出自己的必死決心;陳赫無奈也決定留下。
   翌日,李顯應與景卓裡應外合攻擊外國軍隊;無奈軍備懸殊,城門被外軍攻破。撤離的英來為撿回陳赫丟失的戒指而折返,不幸遇到趕來的外軍士兵;為救出被圍困的英來和陳赫,景卓身受重傷而死。隨後,英來中彈,她拒絕治療欲放棄生命隨景卓而去;陳赫卻表示一定要救活她。李顯應等人終於擊退法軍,望著犧牲的景卓,英徽失聲痛哭。陳赫強忍著頭痛為英來實施了手術;卻不幸在取水的路上被逃跑的法軍刺傷而墮入懸崖。
   被救醒的陳赫已返回現代,他急忙敢來探望昏迷的美娜。陳赫與同事在天台聊天,恍然發現奇怪的腫瘤竟來自於自己腦中,同時,所有的人都認為他僅在現代消失了一天。美娜突然生命垂危,陳赫拚命救治終救回美娜;此時,古代的英來也在手術後醒來。
   陳赫在醫院再次碰到穿越到現代的小春紅。病癒後的陳赫翻查後得知,歷史最終被改變。美娜醒來,陳赫激動地落淚。陳赫來到仁政殿,回憶著與李顯應在一起時的點點友誼,並祝福遙遠的英來可以找到屬於自己的幸福。
   陳赫拿出戒指向美娜求婚,兩人甜蜜微笑。

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